Срок проведения таможенной экспертизы может продлеваться в порядке, установленном законодательством государств-членов таможенного союза

Срок проведения таможенной экспертизы приостанавливается: в случае наличия ходатайства таможенного эксперта (эксперта) перед таможенным органом, назначившим таможенную экспертизу, о предоставлении ему дополнительных материалов, а также проб и образцов;
и в иных случаях, установленных законодательством государств-членов таможенного союза.

В случае, если последний день экспертизы приходится на нерабочий день, днём окончания срока считается ближайший следующий за ним рабочий день»

По окончанию исследования, таможенный орган, проводивший экспертизу, направляет все материалы тому органу, который назначил экспертизу. Предметы и документы, бывшие объектом исследования упаковываются и опечатываются и отправляются в таможенный орган.

По окончанию исследования пробы и образцы: возвращаются, списываются, уничтожаются.

При предоставлении на экспертизу материалов с нарушением требований, начальник ЭКС или его заместитель в течении трёх дней сообщает об этом должностному лицу таможенного органа. Если в течении 10 дней с момента получения материалов не принимаются меры по устранению недостатков, то начальник ЭКС может вернуть товар без проведения экспертизы по ричине: недостаточного объёма материала, ненадлежащего постановления (определения) о назначении экспертизы, несоответствия упаковки, проб и образцов требованиям, отсутствия экспертов или плохой материально-технической базы.