Возглавляет органы военной прокуратуры заместитель Генерального прокурора Российской Федерации -- Главный военный прокурор

В систему специализированных прокуратур, осуществляющих надзор за исполнением законов в закрытых административно-территориальных образованиях, на особо важных объектах и в воинских формированиях ряда министерств и ведомств, входят Второе управление Генеральной прокуратуры РФ и прокуратуры войсковых частей, статус каждой из которых определен Генеральным прокурором РФ. Перечень особо важных объектов определяется Правительством Российской Федерации.

Прокуратуры по надзору за законностью исполнения уголовных наказании имеют статус районных прокуратур и подчиняются соответствующим прокурорам субъектов Федерации. На прокуроров по надзору за соблюдением законов в исправительных учреждениях возложены обязанности по осуществлению надзора за исполнением законов и соответствием законам издаваемых правовых актов, соблюдением прав и свобод человека и гражданина в исправительных учреждениях.

Межрайонные природоохранные прокуратуры со статусом районных и подчинением, соответствующим прокурорам республик, краев, областей, автономных округов созданы во всех субъектах Российской Федерации. Данные прокуроры осуществляют надзор за исполнением законов, направленных на защиту окружающей среды, экологических прав граждан природоохранными органами, предприятиями, учреждениями, организациями, их должностными лицами, общественными объединениями.

Надзор за исполнением экологических законов на территории волжского бассейна -- от истоков до Каспийского моря -- осуществляет Волжская природоохранительная прокуратура, созданная для усиления прокурорского надзора за исполнением законов об охране природы и окружающей среды. Аналогичные задачи решаются Московской природоохранной прокуратурой. Эти прокуратуры имеют низовые звенья (например, Волжская природоохранная прокуратура-17), действующие на правах прокуратур районов. Природоохранные прокуратуры на правах межрайонных прокуратур созданы и в большинстве субъектов РФ.

Структуру Генеральной прокуратуры Российской Федерации составляют главные управления, управления и отделы. В соответствии с приказом Генерального прокурора РФ от 5 февраля 1996 года №12-111 Генеральная прокуратура РФ включает в свой состав:

-- Секретариат Генерального прокурора Российской Федерации (на правах управления);

-- Организационно-контрольное управление;

-- Управление кадров;

-- Управление по надзору за исполнением законов и законностью правовых актов;

-- Главное следственное управление, включающее в себя Управление по надзору за следствием, дознанием и оперативно-розыскной деятельностью в органах внутренних дел;

-- Управление по надзору за расследованием преступлений органами прокуратуры;

-- Организационно-методическое управление;

-- Управление по расследованию особо важных дел;

-- Отдел по надзору за расследованием особо важных дел -- на правах управления;

-- Отдел криминалистики -- на правах управления;

-- Управление по надзору за исполнением законов о федеральной безопасности;

-- Главное управление по надзору за исполнением законов о федеральной безопасности и межнациональных отношениях на Северном Кавказе;

-- Управление по делам несовершеннолетних и молодежи;

-- Второе управление;

-- Управление по надзору за законностью судебных постановлений по уголовным делам;

-- Управление по надзору за законностью постановлений судов по гражданским делам;

-- Управление по обеспечению участия прокуроров в арбитражном процессе;

-- Управление по надзору за исполнением законов на транспорте и в таможенных органах;

-- Управление по надзору за законностью исполнения уголовных наказаний;

-- Управление правового обеспечения;

-- Международно-правовое управление;

-- Отдел реабилитации жертв политических репрессий (на правах управления);

-- Центр информации и общественных связей (на правах управления);

-- Управление по надзору за исполнением налогового законодательства;

-- Отдел писем (на правах управления);

-- Приемная (на правах управления);

-- Первый отдел (на правах управления);

-- Управление делами;

-- Управление делопроизводства;

-- Отдел по делам гражданской обороны, чрезвычайным ситуациям и мобилизационной работе (на правах управления);

-- Отдел безопасности (на правах управления);

-- Главная военная прокуратура.

В главных управлениях, управлениях и отделах устанавливаются должности старших прокуроров и прокуроров, старших прокуроров-криминалистов и прокуроров-криминалистов, а также старших следователей по особо важным делам и следователей по особо важным делам и их помощников.

В соответствии с Конституцией РФ Генеральный прокурор Российской Федерации назначается на должность (сроком на 5 лет) и освобождается от должности Советом Федерации -- верхней палатой Федерального Собрания РФ по представлению Президента РФ. Если предложенная Президентом кандидатура на должность Генерального прокурора не получит требуемого количества голосов членов Совета Федерации, то Президент в течение 30 дней представляет сенаторам новую кандидатуру.