Структура обратной транскриптазы

Обратная транскриптаза – гетеродимер состоящая из двух субъединиц p66 и p51. p66 по совей структуре похож на «разомкнутый кулак» и делится на три субдомена: пальцы, ладонь и большой палец. Обратная транскриптаза имеет два католитическиз домена: активный центра рибонуклеазы Н и активный центр полимеразы.

Субдомен обртаной транскриптазы большой палец подвижен, подобно большому пальцу руки он открывает и закрывает «кулак». Транскрипция РНК возможна только в закрытом положении.

Обратные транскриптазы включают ферменты РНК-зависимой ДНК-полимеразы и ДНК-зависимой ДНК-полимеразы, которые работают вместе для выполнения транскрипции. В дополнение к транскрипции функции, обратные транскриптазы ретровирусных есть область, принадлежащая РНКазы Н семьи, которая является жизненно важным для их репликации.

Существуют три различных системы репликации в течение жизненного цикла ретровируса. Прежде всего, обратной транскриптазы синтезирует вирусные ДНК из вирусной РНК, а затем из новоиспеченных комплементарной цепи ДНК. Второй процесс репликации происходит, когда хозяин сотового ДНК-полимеразы повторяет интегрированной вирусной ДНК. И наконец, РНК-полимераза II транскрибирует провирусной ДНК в РНК, которые будут упакованы в вирионов. Таким образом, мутация может произойти в течение одного или всех этих шагов репликации.

Обратной транскриптазы имеет высокий уровень ошибок при переписывании РНК в ДНК, поскольку, в отличие от любой другой ДНК-полимеразы, он не имеет корректура способности. Такой высокий уровень ошибок позволяет мутации накапливаться в ускоренном темпе по сравнению с корректуру форм репликации. Имеющиеся в продаже обратной транскриптазы производстваPromega указаны их руководства как наличие ошибки ставок в диапазоне от 1 на 17 000 оснований для AMV и 1 в 30000 оснований для M-MLV.

Помимо создания одиночных нуклеотидных полиморфизмов, обратный транскриптазы также было показано, что участие в таких процессах, как запись слияния, экзон перетасовки и создания искусственных антисмысловых транскриптов.