А. Эксцизионная репарация

Тминовые димеры, могут быть в силу ряда причин не восстановлены системой фотореактивации. В этом случае активируются ферменты системы эксцизионной репарации. Этот тип репарации позволяет исправить до 95% спонтанных мутаций. Существует несколько типов реакций эксцизионной репарации. Их объединяет то, что повреждённое основание, нуклеотид или неправильно спаренное основание (мисмэтч) вначале полностью вырезается из цепи, а затем вставляется новый нуклеотид (или нуклеотиды) комплементарный нуклеотиду противоположной цепочки. Приведём в качестве примера эксцизионную репарацию нуклеотидов (тиминовых димеров). Реакция состоит из нескольких этапов. На первом этапе фермент эндонуклеаза находит повреждённую нить ДНК и делает надрез в месте повреждения. Другой фермент экзонуклеаза расширяет надрез, «откусывая» с обоих концов надреза нуклеотиды вместе с тиминовым димером. Образовавшаяся брешь застраивается с одного конца нити ДНК специальным ферментом

Надрез Расширение бреши Застройка бреши Сшивка

(Эндонуклеаза) (Экзонуклеаза) (ДНК-полимераза) (Лигаза)

Тиминовый димер

Рис. 48. Схема эксцизионной репарации тиминовых димеров.

ДНК-полимеразой. При этом вставляемые нуклеотиды комплементарны нуклеотидами не повреждённой нити ДНК. Не застроенной остаётся небольшой разрыв, который сшивается ДНК-лигазой.