VI. Но­менк­ла­ту­ра фер­мен­тов

Об­щее ко­ли­че­ст­во су­ще­ст­вую­щих в при­ро­де ви­дос­пе­ци­фи­че­ских ин­ди­ви­ду­аль­ных фер­мен­тов мо­жет дос­ти­гать со­тен ты­сяч и да­же мил­лио­нов. По­это­му во­прос упо­ря­до­че­ния но­менк­ла­ту­ры фер­мен­тов, их на­име­но­ва­ний в по­след­ние де­ся­ти­ле­тия при­об­рёл чрез­вы­чай­но важ­ное зна­че­ние. С мо­мен­та от­кры­тия пер­вых фер­мен­тов и по сей день бы­ло пред­ло­же­но не­сколь­ко ви­дов но­менк­ла­ту­ры фер­мен­тов. Ка­кие-то из них без­воз­врат­но ус­та­ре­ли, дру­гие же ста­ли раз­ви­вать­ся и при­ме­ня­ют­ся сей­час. Рас­смот­рим их в ис­то­ри­че­ском ра­кур­се:

1) Три­ви­аль­ная но­менк­ла­ту­ра. Ис­то­ри­че­ски пер­вый тип но­менк­ла­ту­ры фер­мен­тов. Это про­стые и про­из­воль­ные на­зва­ния, ко­то­рые в ос­но­ве сво­ей учи­ты­ва­ют толь­ко ис­точ­ник про­ис­хо­ж­де­ния фер­мен­тов и про­цес­сы, в ко­то­рых они уча­ст­ву­ют. При­ме­ра­ми это­го ти­па но­менк­ла­ту­ры мо­гут слу­жить пеп­син (от греч. пеп­сис – пи­ще­ва­ре­ние), трип­син (от греч. трип­сис – раз­жи­жаю) и па­па­ин (от ла­тин­ско­го на­зва­ния дын­но­го де­ре­ва – ис­точ­ни­ка это­го фер­мен­та).

2) Ра­цио­наль­ная но­менк­ла­ту­ра. В ос­но­ву на­зва­ния фер­мен­тов лег­ли на­зва­ния ве­ществ, ко­то­рые рас­ще­п­ля­ют фер­мен­ты + окон­ча­ние аза. На­при­мер, фер­мент, рас­ще­п­ляю­щий са­ха­ро­зу, на­зы­ва­ет­ся са­ха­ра­зой, лак­то­зу – лак­та­зой, ус­ко­ряю­щий гид­ро­лиз крах­ма­ла – ами­ла­зой, гид­ро­лиз жи­ров – ли­па­зой, рас­ще­п­ляю­щий бе­лок по мес­ту пеп­тид­ных свя­зей – пеп­ти­да­зой и т.д.

3) Ана­ли­ти­че­ская но­менк­ла­ту­ра. Ста­ла раз­ви­вать­ся по­сле от­кры­тия ме­то­да­ми ана­ли­ти­че­ской хи­мии при­ро­ды про­сте­ти­че­ских групп фер­мен­тов. На­при­мер, ес­ли про­сте­ти­че­ская груп­па – же­ле­зо­со­дер­жа­щий гем, фер­мент на­зы­ва­ет­ся ге­мин­фер­мен­том, ес­ли пи­ри­док­саль – пи­ри­док­саль­фер­мен­том и т.д.

4) Мо­с­ков­ская но­менк­ла­ту­ра. Бы­ла раз­ра­бо­та­на ко­мис­си­ей по фер­мен­там, соз­дан­ной в 1956 г. в рам­ках Ме­ж­ду­на­род­но­го био­хи­ми­че­ско­го сою­за, впер­вые опуб­ли­ко­ва­на в 1961 г. и вто­рич­но – в 1966 г. Ос­нов­ную роль в этой но­менк­ла­ту­ре ста­ли иг­рать ха­рак­тер суб­стра­та и тип ка­та­ли­зи­руе­мой ре­ак­ции. На­при­мер, фер­мент, де­гид­ри­рую­щий ян­тар­ную ки­сло­ту до фу­ма­ро­вой, стал на­зы­вать­ся сук­ци­нат­де­гид­ро­ге­на­зой. Ес­ли хи­ми­че­ская ре­ак­ция, ус­ко­ряе­мая фер­мен­том, со­про­во­ж­да­ет­ся пе­ре­но­сом груп­пи­ров­ки ато­мов от од­но­го суб­стра­та (до­но­ра) к дру­го­му (ак­цеп­то­ру), то на­зва­ние фер­мен­та вклю­ча­ет так­же на­име­но­ва­ние ак­цеп­то­ра. На­при­мер, фер­мент, пе­ре­но­ся­щий ос­та­ток фос­фор­ной ки­сло­ты с АТФ на глю­ко­зу, на­зы­ва­ет­ся АТФ: D-глю­ко­за-6-фос­фотранс­фе­ра­за:

АТФ + глю­ко­за ® АДФ + глю­ко­зо-6-фос­фат