Аллельные состояния сортов и их частоты у четырех сортов

Поэтому

У сортов А и С аллельные варианты локусов X и Z совпадают. Минимальная частота по аллелям х ₁и z ₁равна 1. Поэтому

У сорта D:60% растений несут аллель х ₃, 40% — аллель x ₇. По локусу Z: 80% растений несут аллель z _l, 20% — аллель z ₁₁.

У сортов В и D минимальные частоты аллеля x ₁— р =0, аллеля x ₃ — p =0,6, аллеля x ₇ — р =0, аллеля у ₂ — р =1,0 и т.д.

Поэтому

Таким образом, сорта В и D наиболее сходные, близкие по частотам аллелей маркерных локусов, а сорта А и В — непохожие, генетически отдаленные.

Для надежной оценки симилярности или показателя Нея трех-четырех локусов совершенно не достаточно Желательно, чтобы каждая хромосома и оба ее плеча были маркированы несколькими локусами, находящимися приблизительно на равных расстояниях друг от друга. Тогда можно предположить, что несходство их аллелей относится и к локусам, сцепленным с маркерными. На практике такая ситуация очень редка, поэтому аллельный состав сортов пытаются сравнить другими, более современными методами молекулярно-генетическими методами (RFLP, RAPD, PCR и т. п.).

Например, для этого пригоден показатель Жаккара (см. раздел 3.2), определяемый по результатам метода RFLP, примененным к сравниваемым родительским формам. В отличие от генетических показателей, описанных выше, здесь оценивают несходство родительских форм не по отдельному набору локусов, а по всему составу ДНК сравниваемых генотипов.

Еще один показатель, оценивающий общее сходство аллельного состава, это R_ij —коэффициент родства сортов (i, j), оцениваемый по их родословным. Упрощенно можно сказать, что R_ij это оценка доли общих аллелей, полученных двумя сортами из-за наличия в их родословных одинаковых сортов-предков. Пример родословных двух сортов представлен на рис. 24.

Интуитивно ясно: чем больше общих предков в двух родословных и чем «позже» они были использованы в процессе выведении этих сортов, тем больше у них общих аллелей. Однако четкая количественная оценка доли общих аллелей возможна лишь на основе специального генетико-математического метода анализа родословных в рамках упрощенных предположений. Такой метод реализован в компьютерной программе, разработанной С.П. Мартыновым (см. раздел 14.3). Для сортов Саратовской-42 и Саратовской-52 с помощью этого метода была получена оценка R =0,22.

(РИСУНОК 24)

Основное предположение метода оценки сходства сортов по родословным — отсутствие влияния отбора в популяциях, полученных после каждого скрещивания предков, на долевой состав аллелей отобранного потомства.

Например, на определенном этапе выведения сорта Саратовская 42 в результате скрещивания Лютесценс 91´Сарроза и последующего отбора в расщепляющейся популяции был получен сорт Саратовская 29 (рис. 24). В методе упрощенно предполагается, что он содержит 50% аллелей сорта Лютесценс 91 и 50% сорта Сарроза.

Это предположение далеко не всегда справедливо, но корректно отразить в модели влияние жесткого направленного отбора после скрещивания на соотношение долей в оставшейся форме практически невозможно. В первую очередь это касается аллелей, определяющих хозяйственно ценные признаки.

Коэффициенты родства применяют для оценки сходства сортов перекрестноопыляющихся культур, гибридных популяций, а также сортов и линий самоопылителей.

Коэффициент R_ij можно использовать для оценки d_ij - дивергентности родителей:

d_ij =(1- ). (32)

7.5. Варианты использования показателей дивергенции

Двухкомпонентный метод. Общий недостаток всех походов к оценке генетической дивергентности потенциальных родительских форм при подборе пар - отсутствие учета близости средних ожидаемого потомства к модели идеального сорта (см. раздел 7.2). Ни дивергентность родителей, ни хорошая выраженность гибридной популяции в отдельности не гарантируют получение перспективного селекционного материала. Рекомендации, т.е. варианты скрещиваний, обычно различаются.

Желательно объединить оба подхода в единой оценке. Простейший вариант такого объединения – двухкомпонентный метод планирования скрещиваний, предложенный С.П. Мартыновым.

Суть метода в использовании отношения— объединенной меры качества любого скрещивания двух родителей

FQ_ij=d_ij/SD_ij,

где d_ij, —расстояние между i -м и j -м родителями [например, показатель (32)], SD_ij — между потомством и идеалом [например, показатель (29)].

Целесообразно организовать на ЭВМ сплошной перебор всевозможных комбинаций простых и сложных скрещиваний и выбрать варианты с максимальными значениями показателя FQ.

Для иллюстрации использованы данные из табл. 28: средние значения пяти признаков за два года для четырех сортов, среднеквадратические отклонения, идеальные уровни и веса десяти годо-признаков. Использованы также коэффициенты родства четырех сортов. Результаты оценок-прогнозов FQ для вариантов скрещивания некоторых из этих сортов, полученные двухкомпонентным методом, представлены в табл. 30.