Вироидная РНК и её особенности

Вироид можно рассматривать как вирусоподобную инфекционную частицу, состоящую из однонитевой, ковалентно замкнутой кольцевой молекулы РНК. Они не имеют никакой белковой оболочки и обладают молекулярной массой примерно около 100 000 Да. Что соответствует примерно 250 000 там 270 000 нуклеотидов. Т.е. очень небольшие молекулы рибонуклеиновой кислоты. Внешне в электронный микроскоп вироиды представляет собой полочковидные структуры, имеющих вид гантелей или что-нибудь подобное. Обладают большим количеством двунитевых участков за счёт спаривания комплементарных последовательностий молекулы этой РНК. Однако как на подобие тРНК (там тоже есть э-э-э двунитевые области), но в отличие от тРНК вироиды не обладают минорными(?) основаниями. Их РНК представлена обычными стандартными нуклеотидами, входящих в состав обычных РНК.

Таким образом вироиды можно рассматривать как «голые» молекулы РНК, обладающие инфекциозными свойствами и способностью воспроизводиться в чувствительных к ним растениям. (ЛЕК. 13, РИС 7)

Выявляется закономерность… вот эти двунитивые области, две петли, за счёт спаривания комплементарных последовательностей, замкнутая в ковалентное кольцо, так что эта двунитевая РНК может иметь и некольцевую форму, а такую… не совсем правильную форму. В центре имеется последовательность, вот обозначенная красным цветом, характеризующаяся высокой степенью консервативностью. И эти последовательности довольно совпадающие и у отдельных групп вироидов.

Структура вироидов подразделяется на несколько доменов. В их центр е располагается, в соответствии с этой схемой, центральный домен – консервативный, домен патогенности, от которого зависит степень выраженности заболевания растения, домен вариабельный, наиболее вариабельная часть последовательности в этой области; и конецевые терминальные участки домена, которые, как полагают, влияют определённую роль во взаимодействии вироидов с ферментами клетки хозяина, которые обеспечивают им репродукцию.

Как всякая нуклеиновая кислота, стандартного типа, должна обеспечивать синтез белков. Вирусная нуклеиновая тоже детерминирует значительное количество белков, которые нужны им в процессе репродукции, либо в процессе формирования своих вирусных частиц при сборки и так тому подобное.

Так вот вироиды, у них не обнаруживаются никаких последовательностей, которые могли бы кодировать белок. У них не иденфицированны стартовые кодоны АУГ с которых трансляция начинается. Отсутствуют сайты взаимодействия с рибосомами, у них не выявлены так называемые открытые рамки считывания, т.е когда имеются стартовый и терминальный кодон. И вот эта последовательность описывается как открытая рамка считывания.

С помощью вироидов …ну опять не были иденфицированны такие специфические белки, свойственные именно вироидам. Хотя при отдельных заболеваниях обнаруживались два небольших белка, которые могут быть продуктами генетического материала вироидов, хотя такие же самые белки обнаруживались и при других заболеваниях и вироидной формы и у здоровых растений.

Дальше… В искусственной системе синтеза белка не удалось получить белковый продукт, используя в качестве иРНК РНК вироида. Ну и возникла тогда проблема, что из себя представляют и откуда берутся эти вироиды и как они воспроизводятся.