Список сокращений. Геномика — направление, изучающее структурно-функциональные межгенные взаимосвязи в процессах физиологической и патологической экспрессии генома

АГ	– антиген
АЗКЦ	– антителозависимая клеточная цитотоксичность
АПК	– антиген-презентирующая клетка
АТ	– антитело
ВИЭФ	– встречный иммуноэлектрофорез
ГЗТ	– гиперчувствительность замедленного типа
ГИО	– гуморальный иммунный ответ
ГКГС	– главный комплекс гистосовместимости
ЕК	– естественные киллеры
ИБ	– иммуноблоттинг
ИФ	– интерферон
ИФА	– иммуноферментный анализ
ИЭМ	– иммунная электронная микроскопия
КИО	– клеточный иммунный ответ
МГ	– молекулярная гибридизация
ОКИ	– острые кишечные инфекции
ОРВИ	– острая респираторная вирусная инфекция
ОТ-ПЦР	– обратно-транскриптазная ПЦР
ПИ	– персистентная инфекция
ПМС	– почка морской свинки
ПСПЭ	– подострый склерозирующий панэнцефалит
ПЦР	– полимеразная цепная реакция
ПЭС	– почка эмбриона свиньи
РГА	– реакция гемагглютинации
РГАдс	– реакция гемадсорбции
РИА	– радиоиммунный анализ
РИФ	– реакция иммунофлюоресценции
РН	– реакция нейтрализации
РОПГА	– реакция обратной пассивной гемагглютинации
РП	– реакция преципитации
РПГА	– реакция пассивной гемагглютинации
РСК	– реакция связывания комплемента
РТГА	– реакция торможения гемагглютинации
РТГАдс	– реакция торможения гемадсорбции
СОЦ	– сердце обезьяны циномольгус
ЦПД	– цитопатическое действие
ЦТЛ	– цитотоксические Т-лимфоциты
ЭВ	– энтеровирусы
ЭМ	– электронная микроскопия
ЭП	– эпидемический паротит

Геномика — направление, изучающее структурно-функциональные межгенные взаимосвязи в процессах физиологической и патологической экспрессии генома. Используется для идентификации, таксономии, изучения процессов эволюции генов и микроорганизмов.

Транскриптомика — направление, изучающее способы, мех-мы и закономерности транскрипции генов, разрабатывающее методы и препараты для ее регуляции и практич.использования.

Протеомика — направление, изучающее структурно-функциональные взаимосвязи и анализ закономерностей биосинтеза отдельных вирусных и кл. белков (их внутриклеточных или сывороточных комплексов), белок-белковых взаимодействий и изменений в процессе инфекции или лечения.

Вирусы имеют кардинальные отличия от других прокариотических м\о:

1. Они не имеют клеточного строения. Это докл. формы.

2. Имеют субмикроскопические р-ры 15-250 и более нм.

3. Хар-ся одним типом НК: ДНК или РНК в качестве генома.

4. Вирусы не обладают собственными системами метаболизма и получения Е.

5. Репликация вирусов происходит в кл. с использованием их белоксинтезирующих и энергетических систем, поэтому они — облигатные внутрикл. паразиты.

6. Вирусы не способны к прогрессивному росту и делению. Они образуются в виде зрелых форм (вирионов) путем самосборки из готовых, т.е. преформированных компонентов (б., НК).

В основу современной классификации вирусов положены следующие основные критерии:

1. Тип НК (РНК или ДНК) и ее первичная структура — сиквенс (одно- или двунитчатая, линейная, циркулярная, непрерывная или фрагментированная).

2. Хар-ка вирионов: наличие белк. оболочки (капсида) или доп. липопротеидной оболочки (суперкапсида), р-р и морфология, тип симметрии.

3. Стратегия вирусного генома в кл. хозяина (используемый вирусом путь транскрипции, трансляции, репликации и выход из нее).

4. АГи физико-хим. св-ва.

5. Феномены генетических взаимодействий.

6. Экологич. взаимодействия (восприимчивые хозяева, географическое распространение).

7. Мех-мы патогенности (хар-р изменений в кл., образование внутрикл. включений, изменения экспрессии генов кл. хозяина, апоптоз и трансформация кл.).

8. Способы передачи и резистентность к факторам внеш.ср. (γ-излучению, t, действию детергентов, эфира, противовирусным пр-там).

На основании критериев вирусы делятся на подтипы, порядки и сем-ва, роды и виды. Вид — группа вирусов, имеющих совпадающие хар-ки (несколько главных св-cтв), составляющих реплицирующуюся линию. Род — группа видов вирусов, имеющих общие св-ва,формируется на основе типового вида, т.е. вида, по своим характеристикам и генетическим связям удовлетворяющего требованиям рода. Семейство — совокупность родов вирусов с общими хар-ками на основе типового рода.

Порядок — группа взаимосвязанных семейств вирусов (не полностью применимо в таксономии вирусов).

Международный Комитет по Таксономии Вирусов (МКТВ). включает классификацию 1550 вирусов, объединенных в 3 порядка, 56 семейств, 9 подсемейств и 203 рода. Мировая коллекция вирусов включает более 30 000 штаммов вирусов. Вирусы человека и животных распределены в 25 семействах: 15 — РНК-геном-ных и 10 — ДНК-геномных.