В молекулах соединений существует определенный порядок связи атомов, который и носит название строение

Химические свойства соединения определяются свойствами и строением его молекулы.

Различное строение при одном и том же свойстве и молекулярной массе вещества обуславливает явление изомерии.

Так как при отдельных реакциях изменяются не все, а только некоторые части молекул, то изучая продукты химических превращений соединения, можно установить его строение.

Химический характер (т.е. реакционная способность) атомов, входящих в молекулу меняется в зависимости от того, с какими атомами они связаны в данной молекуле. Это изменение химического характера обуславливается главным образом взаимным влиянием непосредственно связанных друг с другом атомов. Взаимное влияние атомов, не связанных непосредственно, обычно проявляется значительно слабее.

В конце Х1Х века теория химического строения обогатилась стереохимическими представлениями (Вант-Гофф, Ле-Бель), а с начала ХХ века в органическую химию внедряются электронные представления (Томсон, Коссель, Льюис, Ингольд, Робинсон, Полинг). Вторая половина ХХ века ознаменовалась широким использованием в органической химии квантово-механических представлений.

Большой вклад в развитие органической химии внесли отечественные ученые: А. М. Бутлеров, Н. Н. Зинин, В. В. Марковников, Е. Е. Вагнер, А. Е. Фаворский, Н. Д. Зелинский, М. Г. Кучеров, С. В. Лебедев, В. М. Родионов, А. Н. Несмеянов, Н. Н. Семенов и др.