Принципы систематики и классификации бактерий

Два вида классификаций: филогенетические, или «естественные», и искусственные. Построе­ние естественной классификации состоит в том, чтобы объединить родственные формы, свя­занные общностью происхождения, и на этой основе создать филогене­тическое древо бактерий. Искусственная классификация Она довольствуется объединением организ­мов в отдельные группы на основе их сходства и используется для идентификации и распознавания (определения) организмов.

В основу систематики положено разделение бактерий на микроскопиче­ски легко различаемые формы (кокки, палочки, спириллы), окраска по Граму и отношение к молекулярному кислороду (аэробы, анаэробы) с ориентировкой на 19 групп бактерий, выделенных в определителе Бер­ги (8-е издание, 1974 г.). Цианобактерии добавлены в виде 20-й группы.

Классификация - отнесение конкретного биоло­гического объекта к определенному таксо­ну по совокупности присущих ему признаков. Отношения между таксонами организмов изучает систематика. Номен­клатура, включающей родовое и видовое названия.

В настоящее время разрабатывается классификация всех живых существ, в которой выделены три домена (надцарства): bacteria, archaea, eykarya на основании анализа нуклеотидной последова­тельности 16S рРНК.

Высшими таксономическими категориями являются царства и подцарства. В основе современной систематики микроорганизмов лежат фенотипические признаки: морфологичеческие, физиологические, биохимические. Морфологические характеризуют форму и структуру микробной клетки; физиологические — особенности роста микроорганизма на искусственных питательных средах в определенных условиях культивирования (температура, рН и др.), а также морфологию колоний на твердых средах и характер роста на жидкой среде; биохимические — тип окислительного и пластического метаболизма, ферментацию углеводов, протеолитические и другие признаки.

Нумерическая таксономия признает равноценность всех фенотипических признаков. Для ее применения необходимо иметь информацию о многих десятках признаков. Видовая принадлежность исследуемого микроорганизма устанавливается по числу совпадающих признаков. Расчеты проводятся с помощью компьютера. Для хемотаксонамии применяют физико-химические и биохимические методы: газовожидкостная хроматография, электрофорез и другие, с помощью которых исследуют липидный, аминокислотный состав (протеиновые профили) микробной клетки и ее компонентов, напр., клеточной стенки. Генотаксономия основана на генетических признаках, которые устанавливаются в опытах трансформации, трансдукции и конъюгации. Серотаксономия основана на определении соответствующих антигенов, содержащихся в в бактериальной клетки с помощью диагностических сывороток. Данный метод особенно часто применяется в медицинской микробиологии.

классификация бактерий по источнику питания (аутотрофы и гетеротрофы)

классификация бактерий по источнику энергии (фототрофы и хемотрофы)

классификация бактерий по способу углеродного питания (фотолитотрофы, хемолитотрофы, хемоорганотрофы, прототрофы и ауксотрофы).

Вид — совокупность микроорганизмов, имеющих общий корень происхождения и максимально близкие фенотипические признаки и свойства. Различают морфовары (отличаются по морфологическим признакам), биовары (по биологическим признакам), ферментовары (по ферментативным признакам), фаговары (к фагам), серовары (по антигенной структуре), эковары (по экологическим нишам), патовары (по патогенности).

Иерархия таксонов: Домен→царство→ тип→класс→порядок→семейство→род→вид→подвид.

Колония — скопление бактерий одного вида на (или в) плотной питательной среде.

Чистая культура — популяция состоящая из особей одного вида. Штамм — чистые культуры микробов одного вида, полученные из разных источников или из одного источника в разное время.

Клон — культура микроорганизмов, полученная из одной клетки.

Популяция — совокупность особей одного вида, обитающих в пределах биотопа