Вклад в развитие медицины. · Совместно с А.О.Ковалевским установил общие закономерности в развитии беспозвоночных и позвоночных

· Совместно с А.О.Ковалевским установил общие закономерности в развитии беспозвоночных и позвоночных, заложив тем самым основы сравнительной эволюционной эмбриологии.

· Создал теорию происхождения и развития многоклеточных животных, согласно которой все многоклеточные произошли от примитивно устроенного общего предка, тело которого состояло из слоя наружных клеток и массы внутренних, способных захватывать и переваривать частицы пищи. У различных многоклеточных обнаружил подвижные клетки, способные к внутриклеточному перевариванию, названные им фагоцитами.

· Открыл явление фагоцитоза (1882). Рассматривал его как свойство внутриклеточного пищеварения, закрепленное в процессе исторического развития в качестве защитной реакции организма.

· На основе изучения процессов воспаления, патогенных свойств холерных и других микробов создал фагоцитарную теорию иммунитета. Впервые изложил ее в 1883 г. на УП съезде русских естествоиспытателей и врачей.

· Совместно с Н.Ф.Гамалеей в 1886 г. организовал первую в России бактериологическую станцию для борьбы с бешенством и другими инфекционными болезнями человека и животных.

· В 1888 г. в Пастеровском институте организовал самостоятельную лабораторию, где за 28 лет работы добился общего признания и мировой славы.

· В 1908 г. совместно с Паулем Эрлихом (немецкий врач, бактериолог и биохимик, один из основоположников иммунологии и химиотерапии) удостоен Нобелевской премии.

· Разрабатывал вопросы старости и смерти. Утверждал, что старость и смерть наступают у человека преждевременно. Разрабатывал профилактические гигиенические меры борьбы с самоотравлением организма, рекомендовал стерилизацию пищи, питание кисломолочными продуктами, ограничение потребления мяса.

· Впервые провел экспериментальное заражение человекообразной обезьяны сифилисом (1903), что явилось важной вехой в развитии венерологии.

· Изучал этиологию и эпидемиологию инфекционных болезней: холеры, чумы, брюшного тифа, туберкулеза. В 1911 г. возглавил организованную им экспедицию по изучению туберкулеза среди населения калмыцких степей.

· Автор трудов по методологическим проблемам науки.

· Будучи убежденным материалистом, открыто выступал против идеализма в биологии. В то же время ошибочно полагал, что наука является решающей силой в разрешении всех социальных проблем.